Plant GARDEN
Vitis vinifera

Genome Assembly ID:t29760.G001

配列名:12X

ゲノム配列の詳細

学名 Vitis vinifera
配列名 12X
系統名 PN40024
アセンブリレベル Chromosome
配列数 33
染色体数 2n=38
配列長 (bp) 486,265,422
N50長 (bp) 23,006,712
シーケンシングの方法 Sanger
シーケンシングの方法のコメント NA
取得した配列量 12x
アセンブリ方法 ARACHNE
推定ゲノムサイズ (Mb) 416
登録者 International Grape Genome Program
論文 (DOIコード) 10.1038/nature06148
コメント NA

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染色体 /
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配列の種類 ファイル名 ダウンロード コメント

遺伝子 (cds / gene)

Vitis_vinifera.12X.cds.all.fa.gz

ゲノム

Vitis_vinifera.12X.dna.toplevel.fa.gz

アノテーション (gff / gff3)

Vitis_vinifera.12X.42.gff3.gz

Hayai Annotation ZEN

hayai_annotation_zen_PlantGARDEN_Kegg.tsv.gz

タンパク (pep / aa)

Vitis_vinifera.12X.pep.all.fa.gz

トランスクリプト (cDNA / mRNA)

Vitis_vinifera.12X.cdna.all.fa.gz

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