Plant GARDEN
Chrysanthemum seticuspe

Genome Assembly ID:t1111766.G001

配列名:CSE_r1.0

ゲノム配列の詳細

学名 Chrysanthemum seticuspe
配列名 CSE_r1.0
系統名 XMRS10
アセンブリレベル Scaffold
配列数 354,212
染色体数 2n=18
配列長 (bp) 2,721,839,164
N50長 (bp) 44,741
シーケンシングの方法 Ilumina
シーケンシングの方法のコメント NA
取得した配列量 117.3x
アセンブリ方法 SOAPdenovo2 r240
推定ゲノムサイズ (Mb) 3,055
登録者 Kazusa DNA Research Institute
論文 (DOIコード) 10.1093/dnares/dsy048
コメント NA

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染色体 /
Scaffolds
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その他の配列

配列の種類 ファイル名 ダウンロード コメント

遺伝子 (cds / gene)

CSE_r1.1.cds.gz

ゲノム

CSE_r1.0.fa.gz

アノテーション (gff / gff3)

CSE_r1.1_maker.gff.gz

Hayai Annotation ZEN

hayai_annotation_zen_PlantGARDEN_Kegg.tsv.gz

タンパク (pep / aa)

CSE_r1.1.pep.gz

トランスクリプト (cDNA / mRNA)

CSE_r1.0.transcript.gz

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